Nosiciele tajemnicy to opowieść o więźniach Sonderkommando, zmuszanych przez SS do pracy przy spalaniu zwłok ludzi pomordowanych w komorach gazowych Auschwitz. Tylko nieliczni więźniowie tego komanda doczekali końca wojny. Większość zginęła z rąk esesmanów jako naoczni świadkowie masowej zagłady Żydów.
Komiks opowiada o pełnym tragizmu losie tych więźniów, ich niewyobrażalnym cierpieniu i dramatycznych wyborach, których musieli dokonywać. To także opowieść o bestialstwie i cynizmie morderców spod znaku SS. Fabuła obejmuje szereg zdarzeń, które doprowadziły do wybuchu powstania Sonderkommando w Auschwitz jesienią 1944 r. To próba rekonstrukcji tych wydarzeń i miejsc, w których do nich doszło.