Natsume odziedziczył po babci zbiór paktów z yokai - Księgę Przyjaciół. Chłopak nie chce jednak więzić demonów i postanawia zwrócić im ich imiona. Pewnego dnia, biorąc udział w teście na odwagę, razem z kolegami z klasy wchodzi do opuszczonego szkolnego budynku. Nagle wyczuwa obecność istoty, która nienawidzi ludzi i pragnie porwać wszystkich śmiałków, biorących udział w wyzwaniu. Natsume i Mistrz Nyanko postanawiają poznać tożsamość tajemniczego yokai...