Młodzi X-Men wyruszają na pierwsze misje ratunkowe do różnych krajów świata. W ich trakcie dowiadują się, że profesor Xavier nie jest tak kryształową postacią, jak się wszystkim wydawało. Przed założeniem szkoły ich nauczyciel opuścił swojego syna Davida, mutanta o niekontrolowanej mocy. Teraz David powrócił i chce się zemścić na ojcu. Czy X-Men będą musieli zabić syna swojego mentora, żeby uratować świat? Tymczasem do szkoły dla utalentowanej młodzieży trafia nowa niesforna uczennica – Kitty Pride, a profesor Xavier wraz z wybranymi uczniami zostaje zaproszony na przyjęcie organizowane przez Hellfire Club, stowarzyszenie zrzeszające milionerów, którzy podobno finansują jego szkołę.