Sam Fisher, były komandos z komórki specjalnej Splinter Cell - tajnej agendy operującej w cieniu NSA (National Security Agency - Agencji Bezpieczeństwa Narodowego) jest obecnie na emeryturze. Za to jego wrogowie nie. Prześladowany przez koszmary i wspomnienia z dramatycznej przeszłości, próbuje na nowo poukładać sobie życie. Jednak kiedy tajemnicza organizacja terrorystyczna o kryptonimie KROWE rozpoczyna swą przestępczą działalność, zostaje wezwany ponownie, tym razem nieoficjalnie, by odkryć zbrodnicze plany terrorystów i powstrzymać ich zanim dla świata będzie za późno.